משנת 2014 ועד לגיוסו לצה"ל עבד כמפתח תוכנה במחלקת מחקר ופיתוח בחברת הזנק בתל אביב. בסיום העסקתו זכה מאנשי מפתח בחברה למספר חריג של המלצות בפלטפורמת LinkedIn. הוא נחשב לגאון מחשבים ולעילוי בתחומו.
הנושאים האהובים עליו היו אבטחת מידע, ניתוח אותות ופיתוח תוכנה ואלגוריתמים. כמו כן, היה לו ידע נרחב בשפות: הוא שלט בעברית ובאנגלית ברמת שפת אם, והיה לו גם ידע בסיסי בספרדית, ברוסית ובפרסית.
תומר התגייס לחיל המודיעין במרץ 2016, שם שירת תחילה כקצין מקצוע אקדמאי (קמ"א), ובהמשך כקצין אקדמאי בכיר (קא"ב). בעת שירותו בחיל תרם רבות לביטחון המדינה, זכה בכמה תעודות הערכה ואף היה הרוח החיה בצוות שזכה בפרס ביטחון ישראל במעמד נשיא המדינה.
הוא נעצר ונחקר על ידי שב"כ בחשד לפגיעה חמורה בביטחון המדינה. הוא שהה חודשים בכלא 10, ובערב חג שבועות התשפ"א, 17 במאי 2021, מצא את מותו בנסיבות שלא התבררו עד היום.