בין המתנגדים המרכזיים למינוי הוא ראש המוסד היוצא דדי ברנע. על פי חוות הדעת שהגישה היועצת המשפטית לממשלה גלי בהרב מיארה נגד המינוי היא מתייחסת לעמדת ראש המוסד היוצא וחוות הדעת שהגיש במכתב ששלח לה.
גורמים במערכת הביטחון אמרו כי ראש המוסד הוא התפקיד היחיד שלא נמצא תחת פיקוח רגולטורי למעט הבקרה של ראש הממשלה. לכן נדרש מראש מוסד סטנדרטים גבוהים במיוחד של טוהר מידות. על פי עדויות במערכת הביטחון ראש המוסד דדי ברנע אמר כי מי שיש בעברו הערה פיקודית לא יכול להתמנות לראש מוסד.
התרעות פיקוד העורף