כעת מודים בצה"ל כי השר בן גביר עלה על ספינת חיל הים ואף צילם חלק מהסרטון על סיפון הספינה, כאשר העצורים היו תחת אחריות צה"ל. זאת בניגוד למה שנטען קודם לכן, שלפיו הסרטון הפרובוקטיבי של השר צולם על החוף, כאשר העצורים היו תחת אחריות רשות האוכלוסין ושב"ס.
על פי הדיווח, השר לביטחון לאומי איתמר בן גביר הגיע לכלי השיט של חיל הים כדי להצטלם עם פעילי המשט לפני כשבועיים. בן גביר הגיע לבסיס חיל הים באשדוד וניסה לעלות לנחתת שעליה היו עצורים כל פעילי המשט. קצינה בדרגת סא"ל שעמדה במקום ניסתה למנוע ממנו לעבור וביקשה ממנו להמתין לאישור. בן גביר הזיז אותה ונכנס לנחתת.
בצה"ל סירבו להגיב לדברים, לא בזמן אמת וגם לא היום. מפקד חיל הים, האלוף אייל הראל, כמו גם הרמטכ"ל, רא"ל אייל זמיר, נמנעו מלגנות את התנהגות השר, ולא העניקו גיבוי ציבורי לשני הקצינים אל מול מעשהו של השר. גורם צבאי אמר כי צה"ל העביר מחאה על האירוע לגורם הרלוונטי. "המעשה של איתמר בן גביר והנזק שהוא גרם למדינת ישראל בכל מישור הוא עצום. כולם מבינים כי מעשיו באירוע באשדוד הם שערורייה", אמר הגורם הצבאי.
לדברי בארו, ההחלטה הדרמטית התקבלה בעקבות דו"ח מדאיג שהגיש הקונסול הכללי של צרפת בטורקיה. הדו"ח המקיף מפרט טענות קשות מצד הפעילים, הכוללות אלימות מינית, חשיפה מכוונת לקור, מכות והשפלות חוזרות ונשנות. "כל המעשים הללו עשויים להוות עבירות פליליות, ולכן החלטתי להעביר את הנושא לטיפול התובע הכללי", הצהיר שר החוץ. מארגני המשט הוסיפו כי מספר פעילים אושפזו בבתי חולים מיד עם שחרורם, ולפחות 15 מהם דיווחו במפורש על תקיפות מיניות, לרבות מקרי אונס.