במערכת הביטחון אומרים כי השב"כ האיר בזרקורים אדומים כי יש בעיה באבטחה בנמלי התעופה באיחוד האמירויות, אבל במשרד התחבורה העדיפו להתעלם. גורם ביטחוני אומר הבוקר: "ישנה חלוקת עבודה מאוד ברורה באבטחת התעופה האזרחית בישראל. השב"כ אחראי על כל מעגלי האבטחה של חברות התעופה הישראליות: אל על, ארקיע, ישראייר ואייר חיפה".
על פי הגורם במערכת הביטחון, "השב"כ אחראי על ניטור מודיעין, בדיקת הנוסעים ופיקוח על הצוות, על האבטחה במטוס ובעמדות הצ'ק-אין והשערים של החברות הישראליות בכל נמלי התעופה בעולם. לשב"כ יש רמת אבטחה שעליה הוא לא מתפשר. זאת הסיבה שראש השב"כ דוד זיני קיבל את ההחלטה לעצור את הטיסות הישראליות מאיחוד האמירויות. זה, לדעתנו, היה צריך להדליק מנורות אזהרה במשרד התחבורה, להבין שיש כאן בעיית אבטחה משמעותית. אבל הם לא עשו זאת. וחמור מכך, הם אפשרו לטייסים ממדינות שאין להן קשרים דיפלומטיים עם ישראל להטיס את מטוסי פליי דובאי".
במערכת הביטחון אומרים: "ההתעקשות של השב"כ מול איחוד האמירויות הצליחה. עכשיו מבינים באיחוד האמירויות את הבעיה שהם נמצאים בה בכל הקשור לאבטחת הטיסות בנמלי התעופה שלהם. האמירתים הסכימו כעת לדרישות האבטחה של השב"כ, ובימים הקרובים ניתן יהיה לקדם את החזרת הטיסות הישראליות לדובאי ולאבו דאבי, כאשר השב"כ יפתח מחדש את תחנות האבטחה של הטיסות הישראליות בנמלי התעופה".
במערכת הביטחון אומרים כי הטיסות הזרות החכורות שמפעילות חברות התעופה הישראליות נמצאות תחת הפיקוח של השב"כ, כאשר רמת האבטחה בהן שונה מהאבטחה בטיסות עם המטוסים הישראליים. אולם במערכת הביטחון אומרים כי השב"כ בודק כל אחד מאנשי הצוות, ובכלל זה את הטייסים, הדיילים ואפילו את המכונאים שמתקרבים למטוס על הקרקע, ורק לאחר הבדיקה ניתן אישור ההמראה לישראל. גורם במערכת הביטחון אומר כי חייבים לבצע בדק בית מקיף במשרד התחבורה ולהבין איך אירוע כל כך חמור, שנוגד את כל נוהלי הביטחון, התרחש.
בישראל ממשיכים לנהל, במקביל לחקירה של האמירתים, חקירה ישראלית. מי שמוביל את החקירה הוא צוות של המוסד, המורכב מכמה בעלי תפקידים מבצעיים מאגפים שונים במוסד. המוסד נעזר גם בחוקרי השב"כ בחקירה. ההערכה היא כי כבר בזמן הקרוב יאפשרו האמירתים לצוותי החקירה הישראליים להגיע למדינה כדי לקחת חלק בחקירה.
אחד הדברים עשוי להיות תשאול הטייס. אבל לא רק. סביר להניח כי החוקרים ינסו לשחזר את התנהלות הטייס ביממה שלפני הטיסה, כולל מעקב במצלמות אבטחה. דובאי מכוסה במיליוני מצלמות אבטחה עם אנליטיקה. המוסד מכיר זאת היטב. משטרת דובאי הצליחה להביך את המוסד כאשר אנשיה חשפו עשרות מאנשי המוסד אשר לקחו חלק בחיסולו של בכיר חמאס מוחמד אל-מבחוח. החוקרים נעזרו במצלמות האבטחה, והם ניטרו את אנשי המוסד שהגיעו לפני החיסול וכן הצליחו לסמן את התנועה שלהם ברחבי המדינה.
החוקרים האמירתים אמורים לבנות את הפרופיל של הטייס המפגע, תוך חקירת בני משפחתו, השכנים ומכרים. כמו כן, הם יתחקו אחר ההתכתבויות שלו ברשתות החברתיות וכן יבחנו באילו אתרים גלש. לפי שעה נשמרת ההערכה כי המפגע פעל כ"זאב בודד".
התרעות פיקוד העורף