כפי שנחשף בעבר, בית החולים ומרחבו שימשו לאורך השנים האחרונות את ארגוני הטרור חמאס והג'יהאד האיסלאמי לקידום מתווי טרור נגד אזרחי מדינת ישראל וכוחות צה"ל. זאת, לטענת צה"ל, תוך ניצול מתקן רפואי וחרף קריאות חוזרות מצד ישראל וצה"ל להימנע משימוש צבאי במתקנים רפואיים.
יותר מ-240 מחבלים וחשודים נעצרו במרחב בית החולים
בדצמבר 2024 פעלו כוחות צה"ל במרחב בית החולים, איתרו ציוד צבאי ואמצעי לחימה רבים ועצרו יותר מ-240 ממחבלי ארגוני הטרור חמאס והג'יהאד האיסלאמי ופעילים נוספים החשודים כמחבלים.
כזכור, במהלך הלחימה חשף צה"ל את פעילות חמאס בבית החולים המרכזי בעזה, בית החולים שיפא, אשר שימש כמטה פעילות של חמאס ואף הובאו אליו חטופים. ראשי חמאס ניהלו את פשיטת 7 באוקטובר במנהרת הפיקוד של מח"ט רפיח מתחת לבית החולים האירופי בחאן יונס. צה"ל חיסל את מוחמד סינוואר ואת מח"ט רפיח מוחמד שבאנה בתוך המנהרה, אשר חצתה את כל בית החולים. מרכז הפיקוד היה בעומק של כמה מטרים מתחת לאדמה ובמרחק של עשרה מטרים מחדר המיון, מתחת לחניון האמבולנסים.
התרעות פיקוד העורף