במקביל לפעילות הכוחות, הוטלו הגבלות תנועה על תושבי האזור. על פי הודעת דובר צה"ל, התושבים יוכלו לצאת מהמרחב דרך שלוש נקודות מעבר ייעודיות, שבהן יעברו בידוק ותחקור ביטחוני. מי שיעלה לגביו חשד יועבר להמשך תחקור בידי כוחות הביטחון. המבצע החל לאחר שורת פעולות שננקטו במהלך היום, ובהן הטלת כתר על חברון וחלחול, הצבת חסימות ומיפוי בתי המחבלים. כוחות צה"ל ומג"ב איו"ש פועלים גם בבתי המחבלים ובבתיהם של חשודים נוספים, לצד פעילות בכפרים הסמוכים.
נוסף על כך, החלו הכוחות להסיר תשתיות בלתי חוקיות באזור ההיתקלות, שלפי צה"ל עלולות להוות סיכון ביטחוני. במקביל נמשכת פעילות בעשרות יעדים נוספים ברחבי יהודה ושומרון, על רקע החשש מניסיונות לבצע פיגועים נוספים בתקופה הקרובה.
התחקיר הראשוני: המחבלים תכננו לפגוע באזרחים
מהתחקיר הראשוני עולה כי המחבלים יצאו מחברון כשהם חמושים ברובה, באקדח ובכמות גדולה של תחמושת ומחסניות. בצה"ל מעריכים כי השניים היו בדרכם לבצע פיגוע משמעותי נגד אזרחים באחד היישובים באזור, וכי בכוונתם היה להגיע לכביש 35. אלא שלפי הערכת הצבא, לאחר שהמחבלים הבינו כי לא יוכלו להגיע לציר בשל היערכות הכוחות, הם שינו את תוכניתם ופתחו באש לעבר כוח צה"ל שאייש עמדת בידוק באזור.
ההיתקלות נמשכה כ-20 דקות, ובמהלכה נפגעו חיילי צה"ל. בעקבות הירי הוקפצו לזירה כוחות נוספים ומפקדים בכירים, נפתח מרדף והוצבו חסימות במרחב. בהמשך חוסלו שני המחבלים. בתדרוך שקיים צה"ל לאחר הפיגוע, אמר קצין בכיר כי היערכות הלוחמים מנעה פיגוע משמעותי נגד אזרחים, אך גבתה מחיר כבד. "הכוח מנע פיגוע חמור מאוד נגד אזרחים. שילמנו מחיר כבד, אבל אלמלא הכוח שנערך במקום, המחבלים היו עלולים להגיע לצירים אזרחיים", אמר.
במערכת הביטחון חוששים מניסיונות נוספים לבצע פיגועים ביהודה ושומרון בתקופה הקרובה. על רקע זה הוחלט להרחיב את הפעילות המבצעית באזור, להגביר את הבידוקים והחסימות ולהיערך למעצרים ולפעולות סיכול נוספות. בצה"ל מציינים כי המבצע בחברון יימשך מספר ימים, וכי במקביל תימשך פעילות הכוחות ברחבי יהודה ושומרון לאיתור אמצעי לחימה ותשתיות טרור.