"באופן כללי אני מוטרד מהוויכוח הציבורי שמתנהל בין המוסד לצה"ל ואחרים סביב השאלה מה ישראל צריכה לעשות עם איראן", אמר תומר בפתח הריאיון, "אם אני מבין נכון בתור אזרח ובתור לשעבר אני מבין שהמוסד אמר שהסכם זה לא דבר טוב. זאת, שהתמורה שאנחנו נקבל לביטחון ישראל היא לא מספיק טובה. לעומת זאת, אנחנו מתחייבים בתמיכה בהסכם להימנע מלנקוט סוג של פעילויות מבצעיות. את ההיגיון הזה אני מבין. אני באופן אישי חושב שישראל צריכה לשאוף לשמור על חופש פעולה מקצועי כי היא זו שעומדת בתוך הלומת האש".
"אם אני מבין את ההיגיון של המוסד נכון, אז הרציונל שלו אומר לא להיכנס להתחייבות כי יכול להיות שהסכם לא יקרה כי בזמן הזה ואיראן יכולה לרוץ קדימה. אני שותף להיגיון הזה", הוסיף.
לסיום ציין תומר כי "אני מכיר את דדי ברנע לא רע, ויודע שהוא אדם סופר ענייני. יש כאלה שאומרים שבתור בעל תפקיד כזה הוא אפילו יותר מדי ענייני. הוא איש נקי וחף מכל שיקולים לא ענייניים. מעבר לזה, בעבר אני אמרתי שהמוסד צריך דובר מקצועי כי הוא נוגע בנושאים שהם בליבת הקיום של החברה הישראלית. עיתונאים רבים אמרו שאני מדבר שטויות, וטענו שהוא צריך לשמר על עמימות. השב"כ למשל, פיתח מערך דוברות מסוים, והוא עדיין ארגון חשאי".