ההעברה של חלק מהסמכויות בתוך משרד הביטחון, הקשורות למינהל האזרחי ביהודה ושומרון, הייתה בין הדרישות הקואליציוניות העיקריות של יו"ר הציונות הדתית, וכך גם סוכם בהסכמים הקואליציוניים שנחתמו בין הליכוד לציונות הדתית. העימות נוצר עקב סירובו של גלנט להעביר בפועל את הסמכויות לידי סמוטריץ', בטענה כי זה יפגע בתפקוד התקין של הצבא ובביטחון המדינה באופן כללי.
בעקבות פינוי הכרם התקיימה שיחה קשה בין סמוטריץ' לנתניהו, שבה דרש סמוטריץ' לסיים את המו"מ בנושא, כדי שכבר ביום ראשון תעלה הצעת המחליטים על העברת הסמכויות במשרד הביטחון לאישור הממשלה. נתניהו נפגש עם גלנט, ולאחר שיחה ארוכה, שבה השניים לא הגיעו לסיכומים, הם קבעו להמשיך בשיח.
גורמים בליכוד אומרים בעקבות העימות המתמשך בין השרים כי “גם אם רבים בליכוד מסכימים עקרונית ואידיאולוגית עם סמוטריץ', באותה מידה הם מבינים את עמדת גלנט. כשר ביטחון הוא חייב לתת ביטוי לעמדת מערכת הביטחון. מהמקום שבו הוא נמצא, תגובתו היא לגיטימית. לא מסכימים איתו, אך לא כועסים עליו. בסופו של דבר, נתניהו יוביל לפתרון שיהיה באמצע הדרך“.
בדרג המדיני מעריכים שיושג פתרון בימים הקרובים, וההערכה היא כי ההסכמות בנושא יהיו שונות ממה שנקבע בהסכמים הקואליציוניים.