החלטתו של זמיר גרמה לתדהמה בקרב רבים במערכת הביטחון ומהווה פגיעה נוספת ליציבות המשרד, בייחוד עם כניסתו של שר חדש וחסר ניסיון לתפקיד. זמיר, סגן הרמטכ"ל לשעבר, זוכה להערכה רחבה מצד קצינים בצבא ונחשב לדמות מרכזית בתחום בניין הכוח. בשנה האחרונה היה בקשרי עבודה קרובים עם האמריקאים ובמהלך המלחמה עמד בראש רכש חירום של אמצעי לחימה, כולל מטוסי קרב ותחמושת, ובמקביל קידם את הייצור המקומי בתעשיות הביטחוניות בישראל.
בהודעת משרד הביטחון נמסר כי "השר כ"ץ נפגש היום לפגישת עבודה ראשונה עם המנכ"ל זמיר. זמיר סקר את העשייה הנרחבת של המשרד במלחמת חרבות ברזל, בדגש על הבטחת יכולת עמידה ממושכת של צה"ל במערכה רב-זירתית ועצמאות ייצור ישראלי. המנכ"ל ביקש לסיים את תפקידו בעת הקרובה, ולבקשת השר הוסכם כי ימשיך בתפקידו בשלב זה."
התרעות פיקוד העורף