גורמים בכירים המעורים בפרטים אומרים כי המתיחות בין נתניהו להנגבי נמשכת זה זמן: "זה היה באוויר כבר כמה חודשים, וכולם העריכו שהפיצוץ הוא רק עניין של זמן". לדברי הגורמים, בין השניים התגלעו מחלוקות תכופות במהלך ישיבות הקבינט. "במקרים רבים הנגבי לא התיישר עם עמדות ראש הממשלה", ציינו והוסיפו כי המחלוקת החריפה במיוחד במהלך מבצע 'מרכבות גדעון ב׳' ובנושא עסקת החטופים.
בהודעה של הנגבי נכתב: "ראש הממשלה נתניהו עידכן אותי היום על כוונתו למנות ראש מל״ל חדש. לאור זאת תסתיים היום כהונתי כיועץ לביטחון לאומי וכראש המטה לביטחון לאומי. אעמוד כמובן לרשות מחליפי ככל שיידרש. הודיתי לראש הממשלה על הזכות שהייתה לי להיות שותף לעיצוב מדיניות החוץ והביטחון של ישראל בשנים מאתגרות, על האפשרות להביע עמדה עצמאית בדיונים רגישים ועל השיח המקצועי שניהלנו גם בעת מחלוקות".
עוד הוסיף: "המערכה הרב-זירתית שנכפתה עלינו ב-7 באוקטובר 2023 לא הסתיימה. לוחמינו ניצבים על המשמר בחזיתות רבות, והמשימה להשיב את כל חטופינו טרם הושלמה. עוד לא מומשה גם החובה להבטיח – באמצעים מדיניים או צבאיים – שארגוני הטרור ברצועת עזה יורחקו מהשלטון ויפורקו מנשקם ושמעזה לא יישקף עוד איום על ישראל. האתגרים בזירה המדינית והבין-לאומית נותרו תובעניים, ומחייבים יוזמה ישראלית ופעולה בתבונה, בנחישות ובאחריות".
התרעות פיקוד העורף