אחת הטענות שנבדקו נגעה להצגתו של בן עמי כסגן אלוף במילואים וכמי שמחזיק ברקע ביטחוני. לפי הדיווח, בצה"ל לא הכירו את בן עמי כקצין בדרגת סגן אלוף. בן עמי הסביר בשיחה עם מניב כי מדובר בדרגת ייצוג שקיבל במסגרת פעילותו עם מתנדבים, אולם על פי הדיווח, גם בעמותה שאליה פנו בחדשות 12 לא הכירו את שמו.
בשיחה עם מניב אמר בן עמי כי שימש "מפקד יחידת שראל" וכי מדובר היה בדרגת ייצוג. כשנשאל אם אי פעם לבש מדים עם דרגות סגן אלוף, השיב: "אני לא הייתי במדים".
סימן שאלה נוסף הועלה סביב התואר האקדמי שבו מחזיק בן עמי. על פי הדיווח, בן עמי הציג עצמו כדוקטור, אולם מניב טען כי התואר ניתן על ידי אוניברסיטה שהוגדרה בתחקיר כ"פיקטיבית". עוד נטען כי בן עמי אף נקרא בעבר למסור עדות במשטרה במסגרת חקירה שעסקה במכירת תארים מאותה אוניברסיטה.
בריאיון שצוטט בתחקיר נשמע בן עמי אומר: "הייתי בשלוש השנים האחרונות מרגל... שהם לא יכולים לקבל כזה דבר. נכנסתי לאולם איך שרציתי, לכנסת של איראן איך שרציתי. הייתי מיודד עם סגן שר ההגנה. לחיצת יד עם אחמדינג'אד. תמונה של אלי כהן הייתה מול העיניים שלי. אני בחיים לא אראה שוב, לא את המשפחה שלי, לא את מדינתי ואולי לא את החיים בכלל".
אלא שבשיחה שקיים מניב עם בן עמי במסגרת התחקיר, האחרון הסתייג מההגדרה "מרגל". כאשר נשאל על דבריו הקודמים השיב: "אני בחיים לא אגיד שהייתי מרגל, מה שהיה היה". כשמניב אמר לו כי במוסד לא מכירים בקיומו, השיב בן עמי: "לא עבדתי עם המוסד". בתגובה לשאלה על הקשרים שטען כי היו לו עם סגן שר ההגנה האיראני אמר: "יש ספר שלם על זה".
תגובת מישאל בן עמי: "הייתי מפקד מדור מתנדבי חו"ל בישראל בשנות ה-80 בדרגת ייצוג סא"ל. את הדוקטורט עשיתי באוניברסיטת יורק. עמדתי בכל המטלות הנדרשות. ספרי 'פצצה מתקתקת' שימש מקור לכתיבת סרטים רבים בז'אנר. מעולם לא הפצתי קונספירציות. אני כותב הרבה מאוד מאמרים וניירות עמדה שאני מציג למקבלי ההחלטות".
התרעות פיקוד העורף