לאחר שירותו הצבאי המשיך שחר לעשייה ציבורית וניהולית, ומילא תפקידים בכירים בעיריית נתניה ובמשרד לביטחון הפנים. בהמשך מונה למנכ"ל משרד התיירות. במהלך כהונתו כמנכ"ל משרד התיירות התמודד שחר עם שתי תקופות משבר משמעותיות עבור מדינת ישראל וענף התיירות - תחילה ההתאוששות ממשבר הקורונה ובהמשך מלחמת חרבות ברזל והשלכותיה, זאת במקביל לשירות מילואים אינטנסיבי.
עם פרוץ המלחמה הוביל שחר את המענה הממשלתי לקליטת תושבי יישובי הצפון והדרום שפונו מבתיהם, ובכלל זה את מערך השהייה במלונות ובמתקני אירוח ברחבי הארץ. במסגרת זו נדרש לניהול מערכת מורכבת בזמן חירום, לעבודה מול משרדי ממשלה, רשויות מקומיות, בתי מלון וגורמי מקצוע רבים, ולמתן מענה לאלפי משפחות שנאלצו לעזוב את בתיהן לתקופות ממושכות.
תא"ל (מיל') דני שחר מסר: "כל חיי פעלתי מתוך תחושת שליחות ואחריות למדינת ישראל - כלוחם וכמפקד בצה"ל וכמנהל בשירות הציבורי. הניסיון שלי, הן בשדה הביטחוני והן בניהול מערכות ציבוריות בשגרה ובחירום, לימד אותי שבשעות המורכבות ביותר מדינה זקוקה להנהגה שיודעת לקבל החלטות, לעמוד בלחצים ולקחת אחריות".
עוד הוסיף: "במהלך המלחמה ראיתי מקרוב את ההתמודדות של תושבי הצפון והדרום שנאלצו לעזוב את בתיהם ואת החשיבות של מדינה מתפקדת שיודעת לתת לאזרחיה מענה בזמן אמת. זו הסיבה שאני תומך באביגדור ליברמן ובישראל ביתנו. ליברמן הוא מנהיג חזק ומנוסה, בעל תפיסת ביטחון ברורה, עמוד שדרה ויכולת ביצוע. מדינת ישראל זקוקה היום להנהגה עם ניסיון, נחישות ואומץ לקבל את ההחלטות הנכונות לביטחון המדינה ולעתידה".
התרעות פיקוד העורף