כמעט כל הקלפיות ברחבי הארץ ממוקמות בבתי ספר או במרכזים קהילתיים המצוידים במרחבים מוגנים תקניים. כדי להבטיח את ביטחון המצביעים, ועדת הבחירות המרכזית דאגה להציב בכל מתחמי ההצבעה שילוט ברור ובולט המפנה את האזרחים אל המרחב המוגן הקרוב ביותר במקרה שתהיה אזעקה. במקרה כזה, תופעל מצלמה שתפקח על טוהר הבחירות.
במקביל, גם ספירת הקולות תזכה להגנה מלאה ותתבצע בחניון הכנסת, המהווה מתחם תת-קרקעי ממוגן המאפשר רציפות תפקודית מלאה ושמירה הדוקה על טוהר הבחירות גם תחת מטחי טילים. בנוסף, על שולחנות הספירה יונחו מפות שבמקרה הצורך יוכלו לקפל בצורה מהירה ו"להקפיא" את מצב הספירה.
מעבר להתמודדות עם האיום הפיזי, החמ"ל ערוך להתמודד גם עם ניסיונות לוחמה פסיכולוגית והפצת חדשות שווא (פייק ניוז) שמטרתן להרתיע מצביעים מלהגיע לקלפיות. צוותים ייעודיים במרכז השליטה יעקבו באופן רציף אחר הרשתות החברתיות והאזכורים השונים ברשת, ויטפלו בזמן אמת בכל הודעת פייק ניוז או הנחיה מזויפת.
מוקדם יותר היום, הודיע השב"כ כי במסגרת פעילות משותפת עם מחלקת הסייבר בפרקליטות ועם ועדת הבחירות המרכזית אותרו פרופילים ברשת שמשמשים לפעילות השפעה זרה לקראת הבחירות. הפרופילים הוסרו. מוועדת הבחירות המרכזית נמסר ל'מעריב': "הוועדה, בשיתוף כלל גורמי הביטחון ובהם המשטרה, השב"כ ופיקוד העורף, ערוכים לכל תרחיש".