הזוג יצא לירח הדבש ב-20 במאי, אך משפחותיהם דיווחו על היעלמותם ארבעה ימים לתוך הטיול. ב-23 במאי, היום בו הזוג נעלם, ראג'ה נרצח באכזריות. גופתו המתפוררת נמצאה עם גרון חתוך, כשהוא גם חסר ארנק, טבעת זהב ושרשרת.
על פי המשטרה, סונאם הציעה 20 רופי לרוצחי בעלה, אך לבסוף אמרה שתיתן 15 רופי. קצין משטרה בכיר גילה פרטים מעניינים על התלבטויות ברגע האחרון: "ראג' קושוואהא טוען שהוא לא רצה לתמוך בסונאם וברגע האחרון, ביטל את התוכנית שלו לנסוע למגהלאיה. הוא גם כביכול ביקש משלושת האחרים לא ללכת, אך הם נסעו לאחר שסונאם הזמינה אותם. אפילו ברגע האחרון, השלושה סירבו להרוג, אך סונאם התעקשה ואמרה שתיתן 15 רופי בעבור זה". למרות שקושוואהא לא נסע כשהרצח קרה, הוא היה בקשר קבוע עם סונאם, על פי המשטרה.
כפי שציין מקור מצוות החקירה המיוחד של משטרת מגהלאיה: "התנועה המתואמת אך הנפרדת שלהם מעידה שגם הלוגיסטיקה של הבריחה לאחר הרצח תוכננה היטב".
במהלך התקופה הזו התנהל מצוד שכלל משטרה, צוותי סיוע באסון ותושבים מקומיים. המשטרה קיבלה מידע וסרקה מספר צילומי מצלמות אבטחה כדי לעקוב אחר תנועותיה של סונאם.
דיווחים מציינים כי המשטרה ידעה שסונאם עומדת מאחורי הרצח ימים לפני כניעתה. בסופו של דבר, סונאם נתפסה מאוחר ביום ראשון כשהופיעה במסעדה וטלפנה בדמעות לאחיה, שהודיע מיד לרשויות, כפי שדיווח ה-Times of India. היא הסגירה את עצמה ביום שני ה-9 ביוני.
התגובות המשפחתיות היו מורכבות. אביה של סונאם, שעדיין לא דיבר עם בתו, טען לחפותה וטען שהיא "איכשהו הצליחה לברוח מחוטפיה" ושהמשטרה "ממציאה סיפורים".