המשמעות היא שהמדרגות, הפינות הישרות והמשטחים הרחבים אינם בהכרח עדות לעבודת יד אדם - אלא דווקא הדגמה ליכולת של הטבע ליצור תצורות מרשימות במיוחד. כיום, רוב החוקרים סבורים כי "מונומנט יונאגוני" הוא תופעה גיאולוגית ייחודית ולא שריד של תרבות אבודה. למרות זאת, המראה יוצא הדופן של האתר ממשיך למשוך אליו צוללנים מרחבי העולם, והוויכוח סביבו כנראה עוד רחוק מלהסתיים.
ומה שנותר בשיח הפתוח: הוא גם אם המדע נוטה להסביר את המבנה כתוצאה של תהליכים טבעיים, עצם קיומו ממשיך להצית את הדמיון. עבור רבים, הדמיון למדרגות, טרסות ופלטפורמות עצומות מזכיר יותר אתר עתיק מאשר תצורת סלע רגילה. לכן, למרות ההסברים הגיאולוגיים, "מונומנט יונאגוני" נשאר אחד האתרים המסקרנים ביותר בקרקעית האוקיינוס - כזה שממשיך להזין את השאלה הגדולה: האם יום אחד תתגלה מתחת למים עדות אמיתית לציוויליזציה אבודה?