טקס הלוויה יחל בשעה 10:00 שעון מקומי (11:00 שעון ישראל) בפתח בזיליקת סן פטרוס בעיר הוותיקן, כאשר ההכנות לקראת הקונקלאווה - התהליך שבו יבחרו הקרדינלים את האפיפיור הבא - כבר החלו.
בפעם האחרונה שנצפה בציבור, בוקר חג הפסחא, אמר פרנציסקוס: "אני מביע את קרבתי לסבלם של הנוצרים בפלסטין ובישראל, ולכל העם הישראלי והעם הפלסטיני... אני פונה לצדדים הלוחמים: קראו להפסקת אש, שחררו את בני הערובה ובואו לעזרתו של עם מורעב השואף לעתיד של שלום".
ב-11 בדצמבר 2013 נבחר לאיש השנה של המגזין טיים לשנת 2013. בשנת 2017 נבחר על ידי הטיים מגזין כאחד ממאה האנשים המשפיעים בעולם. ב-25 וב-26 במאי 2014 ביקר האפיפיור פרנציסקוס בישראל. במסגרת ביקורו זה ביקר גם ביד ושם.