רבים מהמגורשים, מתגוררים באיראן במשך עשרות שנים. אחת הטענות הנפוצות במדינה, היא כי חלקם ריגלו עבור ישראל.
לפי דיווחים של רשת "איראן אינטרנשיונל", שבסיסה בלונדון ומזוהה עם האופוזיציה האיראנית, גוברות לאחרונה פעולות הבדיקה, ההשפלה והגירוש מצד הרשויות האיראניות כלפי אפגנים. הסיבה המרכזית שמציינות הרשויות - חשד לשיתוף פעולה עם ישראל.
על פי הדיווחים, אזרחים אפגנים באיראן מתמודדים עם מעצרים פתאומיים, חקירות ממושכות, בדיקות פולשניות של טלפונים ניידים ואף איומים בגירוש מהיר מהמדינה. חלקם מדווחים כי נעצרו בשל "כניסה לא חוקית" או עבודה ללא היתר, אולם בפועל, החשד המרכזי, גם אם לא מוצהר באופן רשמי, הוא לכאורה מעורבות בפעילות מודיעינית נגד המשטר.
התרעות פיקוד העורף