בתגובה פרסם קומי סרטון באינסטגרם בו אמר: "ליבי שבור עבור משרד המשפטים, אבל יש לי אמון רב במערכת המשפט הפדרלית, ואני חף מפשע. אז בואו נעשה משפט ונשמור על האמונה".
בארה"ב ישנן טענות שונות לפיהן מדובר באישום פוליטי. התובע הפדרלי בווירג'יניה, שהיה אחראי על ניהול התיק, התפטר בשבוע שעבר לאחר שהביע ספקות לגבי התיק, בעוד אחרים במשרד המשפטים אמרו כי הראיות אינן מצדיקות הגשת כתב אישום פלילי, כך על פי מקורות המעורים בנושא.
טראמפ פיטר את קומי ב-2017, בתחילת כהונתו הראשונה בתפקיד. מאז הוא תקף באופן קבוע את התנהלותו של קומי בחקירת ה-FBI שפירטה את המגעים בין רוסיה לקמפיין של טראמפ ב-2016.
מאז שטראמפ חזר לתפקידו בינואר האחרון , משרד המשפטים של ממשלו בחן את עדותו של קומי משנת 2020, שבה התייחס לביקורת הרפובליקנים על חקירת רוסיה והכחיש כי אישר גילוי מידע רגיש לתקשורת. כתב האישום טוען כי קומי הטעה את הקונגרס בטענה שלא אישר לאף אחד אחר להיות מקור אנונימי בדיווחי חדשות על חקירת FBI.
ממשל טראמפ ניהל קמפיין נרחב לשינויים במשרד המשפטים, שלטענת הנשיא שימש כנשק פוליטי כאשר עזב את תפקידו בשנת 2021. טראמפ עמד בפני אישומים פדרליים בגין טיפול לקוי במסמכים מסווגים ובניסיון לבטל את תבוסתו בבחירות 2020. שני התיקים בוטלו.
טראמפ וקומי ניהלו מערכת יחסים סוערת מתחילת כהונתו הראשונה של הנשיא. טראמפ פיטר אותו מתפקיד ראש ה-FBI ימים ספורים לאחר שקומי אישר בפומבי כי הנשיא נמצא תחת חקירה על קשרים לכאורה בין קמפיין הבחירות שלו לרוסיה. קומי התגלה לאחר מכן כמבקר בולט של הנשיא, וכינה אותו "לא כשיר מבחינה מוסרית" לתפקיד.
הביקורת הפנימית במשרד המשפטים של ארה"ב מצאה טעויות רבות בהליך החקירה אך קבעה כי לא הייתה בה הטיה פוליטית. הרפובליקנים טענו זה מכבר כי החקירה נועדה לערער את ממשלו הראשון של טראמפ.
בדו"ח משנת 2019, גוף הפיקוח הפנימי של משרד המשפטים האשים את קומי על כך שביקש מחבר למסור לניו יורק טיימס תזכירים המפרטים את האינטראקציות האישיות של קומי עם טראמפ. משרד המשפטים במהלך כהונתו הראשונה של טראמפ סירב להגיש כתבי אישום פליליים נגד קומי.