פרקליט המדינה הגיש עד כה כתבי אישום נגד כ-300 אנשים הקשורים לקבוצות חמושות המועסקות בכוחות הביטחון של הממשלה וכ-265 הקשורים לקבוצות מיליטריות נאמנות לאסד, כך לפי הדיווחים בתקשורת הממלכתית.
לפי הדיווחים, הנאשמים נשאלו על ידי בית המשפט בנוגע להאשמות ברצח אזרחים והשתתפות במתקפות נגד כוחות ביטחון של הממשלה, לפי דיווחים מהשידורים הטלוויזיוניים, וסרטונים שהופצו ברשתות חברתיות. בניגוד לדיווחים ראשוניים שהעריכו כי המשפטים יסתיימו במהרה, השופט דחה את הדיון וקבע את מועד השימוע הבא לדצמבר.
התקשורת הממלכתית דיווחה כי כתבי האישום נגד החשודים עשויים לכלול סדיזם, הסתה למלחמת אזרחים, תקיפה של כוחות ביטחון המדינה, רצח, שוד ושיוך לחבורות חמושות. מבקרי הממשלה טוענים כי התהליך המשפטי חסר עצמאות, אך הרשויות מציינות כי הן מחויבות לאחריות משפטית, בניגוד לשלטון משפחת אסד שנמשך 50 שנה, כאשר מעטים מהאחראים על פשעים ממסדיים נענשו.
כאמור, העימותים פרצו בתחילת מרץ לאחר מתקפות מתואמות של לוחמי משטר נאמני אסד על חברי כוחות הביטחון של הממשלה הזמנית, לפי חקירת האו"ם. אך התקפת נגד של הממשלה התפשטה במהרה למתקפות נקמה עדתיות ולטבח של מאות אזרחים עלווים בפרובינציות החוף, שם מרוכז המיעוט.
בימים שלאחר מכן, חברי קבוצות חמושות שבשליטת או קשורות באופן רשמי לממשלת סוריה הזמנית ביצעו רציחות מחוץ למשפט, עינויים והפרות אחרות, לפי חקירות האו"ם והממשלה. לפי "פיננשל טיימס", האו"ם ציין כי “לא נמצאו ראיות למדיניות ממשלתית או תכנית לבצע את המתקפות הללו”.
במקרים מסוימים ניסו כוחות הממשלה להגן על האזרחים מהתקפות, אך הממצאים של האו"ם מראים שגם הרשויות עצמם לא הצליחו להשתלט על חלק מהפרעות.