בלב המחלוקת עומד אפיון המטוס עצמו: צרפת דורשת מטוס דור-הבא בעל יכולת נשיאת נשק גרעיני והמראה מנושאות מטוסים, יכולות שהצבא הגרמני, הבונדסוור, אינו זקוק להן בשלב זה. "צרפת רוצה לבנות מטוס אחד ולהתאים אותו למפרט שלה, אך זה לא מה שאנחנו צריכים", הסביר מרץ. פער זה מעלה שאלה מבנית קריטית לגבי התוכנית, האם השותפות ייצרו כלי טיס אחיד או גרסאות נפרדות.
פרויקט ה-FCAS נועד להחליף את מטוסי היורופייטר הגרמניים והראפאל הצרפתיים סביב שנת 2040, באמצעות מערכת המשלבת מטוס חמקן, כטב"מים וטכנולוגיות ענן קרבי. עם זאת, הפרויקט סבל מדחיות חוזרות ונשנות בשל סכסוכים תעשייתיים, בעיקר בין 'דאסו' הצרפתית ל'איירבוס' המגובה על ידי גרמניה. גורמים רשמיים בשתי המדינות הודו לאחרונה באפשרות שמרכיב מטוס הקרב המשותף עלול להיכשל, גם אם טכנולוגיות אחרות במיזם ישרדו.