בעקבות המהלך, ישראל קיבלה נזיפה נדירה מצד אזרבייג'ן, בעלת הברית הקרובה. משרד החוץ של אזרבייג'ן אמר כי ההחלטה הישראלית היא עניין של "דאגה רצינית". המשרד כינה את ההכרה "עיוות של העובדות ההיסטוריות" ו"צמצום של נושא היסטורי מורכב להחלטה פוליטית". המשרד הוסיף כי להחלטה אין בסיס משפטי או אקדמי מוצק, והיא אינה מקובלת.
"פעולות כאלה אינן תורמות לפיוס או להבנה הדדית. במקום זאת, הן מעמיקות את הפילוג הקיים ומערערות את המאמצים להשיג שלום ויציבות מתמשכים באזור", נכתב בהצהרה. המשרד קרא לממשלת ישראל לשקול מחדש את החלטתו.
לאזרבייג'ן ולישראל יש קשרים הדוקים, ובאקו היא אחת מספקיות הנפט העיקריות של ישראל, בעוד שישראל מוכרת נשק מתקדם לממשלת אזרבייג'ן. בשנה שעברה, באקו ביקשה להקל את המתיחות בין טורקיה לישראל בנוגע לסוריה ועזה על ידי אירוח שיחות בין שני הצדדים.
טורקיה ואזרבייג'ן רואות זו את זו כבעלות ברית קרובות. על פי הצהרת שושה משנת 2021, שני הצדדים מחויבים לתמוך זה בזה אם אחד מהם מותקף על ידי צד שלישי. טורקיה וישראל תמכו באזרבייג'ן במהלך העימות בנגורנו-קרבאך בשנת 2020, כאשר באקו כבשה שטחים גדולים שנכבשו על ידי ארמניה.
התרעות פיקוד העורף