לדברי הגורם האמריקני, משטר אסד אחסן ב"אתר 99" גם שאריות ושרידים נוספים מאתר אל-כיבאר. אף שאי אפשר להשתמש בחומר שבאתר לייצור נשק גרעיני, ניתן להשתמש בו לייצור "פצצה מלוכלכת" - מטען נפץ קונבנציונלי שמפזר חומר רדיואקטיבי כדי לזהם אזור, במקום ליצור פיצוץ גרעיני. הגורמים הישראלים אמרו כי צה"ל הפציץ את הכניסות לאתר זמן קצר לאחר נפילת משטר אסד, כדי למנוע גישה אליו.
הממשלה של המנהיג הסורי המודח בשאר אל-אסד טענה כי האתר בדיר א-זור שכלל את המבנה היה בסיס צבאי קונבנציונלי. הסוכנות הבינלאומית לאנרגיה אטומית הגיעה למסקנה ב-2011 כי המבנה "סביר מאוד" שהיה כור שנבנה בסוד ושדמשק הייתה צריכה לדווח עליו.
מאז אז מנסה הסוכנות להגיע למסקנה חד-משמעית, ובמסגרת מאמץ מחודש בשנה שעברה הצליחה לקחת דגימות סביבתיות בשלושה מקומות לא מזוהים "שלכאורה היו קשורים מבחינה פונקציונלית" לדיר א-זור, כך צוין בדוח הסודי שרויטרס עיינה בו.
כפי שפורסם ב"טורקיה היום", המתקן המדובר היה בסבירות גבוהה כור גרעיני שנבנה בסיוע צפון קוריאה, בטרם הושמד בתקיפה אווירית של ישראל בשנת 2007. הסוכנות החלה בביקורות במקום ב-2008, אך אלו הופסקו ב-2011 עם פרוץ מלחמת האזרחים. תחת הממשל הסורי החדש בראשות אחמד א-שרע, שנכנס לתפקידו בדצמבר 2024 לאחר הדחת בשאר אל-אסד, חודשה הגישה לאתר באופן חלקי. דגימות שנלקחו בשנת 2025 אישרו הימצאות שרידי אורניום שמקורם בפעילות אנושית במקום.
התרעות פיקוד העורף