העימות החל לאחר שטורקיה פרסמה הודעת NAVTEX, המזהירה כלי שיט מפני פעילות מתוכננת באזור. לפי ההודעה, ספינת המחקר TÜBİTAK MARMARA תערוך מחקרים מדעיים מדרום-מערב לקסטלוריזו בין 1 ל-15 בספטמבר.
יוון הגיבה בהודעה נגדית וטענה כי התחנה הטורקית באנטליה אינה מוסמכת לפרסם הנחיות ניווט באזור. באתונה הוסיפו כי אחת מנקודות המחקר שהגדירה טורקיה נמצאת מעל מדף היבשת היווני. בין המדינות אין גבול מוסכם של אזור כלכלי בלעדי באזור, והן מחזיקות בפרשנויות מנוגדות באשר לזכויותיהן הימיות.
אנקרה התעלמה מההתנגדות והספינה הטורקית יצאה לדרכה. לפי דיווחים ביוון, היא פועלת במים בינלאומיים, מעט מעבר לטווח של שישה מיילים ימיים מהאי. כלי שיט של משמר החופים היווני הוצב באזור ועוקב אחר תנועותיה ממרחק, בתיאום עם חיל הים היווני.
על פי דיווחים שטרם קיבלו אישור רשמי, העימות לווה גם בפעילות אווירית וצבאית מוגברת. בפרסומים ברשתות החברתיות בטורקיה נטען כי יוון הפעילה כטב"ם מסוג הרון לצורך מעקב אחר ספינת המחקר, וכי טורקיה שיגרה בתגובה כטב"ם מאזור דלמאן.
עוד נטען כי צוללת טורקית עגנה בנמל קאש, הנמצא מול קסטלוריזו. עם זאת, לא ברור אם הגעתה לאזור הייתה קשורה ישירות למשימת ספינת המחקר, והטענות בדבר פעילות הכטב"מים והצוללת לא אומתו באופן עצמאי.
בתוך כך, ארדואן התייחס לפעילותה של יוון באיים בים האגאי ובמזרח הים התיכון. "אם נשמיע קול מקאש לעבר יוון, הם ישמעו אותנו, נכון?", אמר לעיתונאים בטיסה חזרה מבישקק. לדבריו, טורקיה אינה מעוניינת בשטחה של מדינה אחרת, אך לא תאפשר לאיש לפגוע בזכויותיה.
פרטים רשמיים מלאים על השיחה לא נמסרו, אך לפי הדיווחים הצדדים דנו ביחסים בין המדינות ובהתפתחויות האזוריות, והסכימו לחזק את שיתוף הפעולה בין ארגוני המודיעין. הפגישה מצביעה על ניסיון להשאיר את ערוצי התקשורת פתוחים, גם כאשר המחלוקת הימית חוזרת לשטח.