"גם אם אתם חושבים שטורקיה עומדת לפלוש אלינו, אתם באמת חושבים שהברית האסטרטגית הזאת עם ישראל תעזור לנו מבחינה צבאית?", תהה ורופאקיס. "האם אתם באמת, אי פעם, חושבים שישראל תרים אפילו את האצבע הקטנה שלה נגד חיל האוויר הטורקי אם יהיה בכך צורך? בשום פנים ואופן".
לדבריו, השותפות עם ישראל אינה מעניקה ליוון ביטחון נוסף מול אנקרה. "אנחנו לא מרוויחים דבר מההתייצבות לצד מדינה שמבצעת רצח עם", טען ורופאקיס, בהתייחסו למדיניות ישראל בעזה, "אבל אנחנו מפסידים הרבה, משום ששמה הטוב של יוון נגרר בבוץ בעצרת הכללית של האו"ם". כידוע, ישראל דוחה את ההאשמה כי היא מבצעת רצח עם וטוענת כי פעילותה הצבאית נועדה להתמודד עם איומים ביטחוניים.
ורופאקיס תקף בתקופה האחרונה שוב ושוב את התפיסה הרווחת בחלק מהמערכת הפוליטית היוונית, שלפיה ההתקרבות לישראל משמשת משקל נגד לעוצמתה הצבאית של טורקיה. עוד בשנה שעברה אמר כי מי שמאמין שישראל תתערב לטובת יוון אם טורקיה תפעל נגד אחד מאיי יוון "צריך להיות טיפש", כלשונו. מפלגתו, MeRA25, טענה גם ביולי כי תוכנית "מגן אכילס" קושרת את מערכת הביטחון היוונית לישראל ולתוכניות נאט"ו, במקום להפחית את הסיכון לעימות.
יש הטוענים כי הביקורת של ורופאקיס אינה עניינית אלא אידיאולוגית וואנטי ישראלית. ורופאקיס מוכר זה שנים כמבקר חריף במיוחד של ישראל ומדיניותה כלפי הפלסטינים, וביתר שאת מאז פרוץ המלחמה בעזה. הוא מאשים את ישראל ב"אפרטהייד", ב"טיהור אתני" ובביצוע "רצח עם" בעזה, וטען כי מדינות אירופה המספקות לה תמיכה מדינית וצבאית שותפות לאחריות למעשיה.
בחודש מרץ, בראיון לעיתון הטורקי "הורייט", הלך ורופאקיס צעד נוסף והשווה בין מדיניות החוץ של שתי היריבות הוותיקות. "טורקיה השיגה את מה שיוון לא הצליחה לעשות. אנחנו נפלנו תחת השפעת ארצות הברית וישראל. אף אחד כבר לא לוקח את יוון ברצינות", אמר. הוא שיבח את אנקרה על כך שלדבריו הצליחה לשמור על יכולת תמרון בין גושים יריבים ולהציג עצמה כמתווכת בסכסוכים אזוריים.
במרכז שיתוף הפעולה החדש נמצאת תוכנית "מגן אכילס", שנחתמה בתל אביב ב-31 באוגוסט. במסגרת העסקה, שעלותה 3.035 מיליארד אירו, תקבל יוון מערכות ישראליות ובהן "קלע דוד", ספיידר ו BARAK MX, לצד מכ"מים ומערכת שליטה ובקרה ארצית. ההסכם הוא עסקת הייצוא הביטחוני הגדולה ביותר שנחתמה אי פעם בין ישראל ליוון.
ההתקרבות בין ישראל ליוון התפתחה במקביל להידרדרות ביחסי ישראל וטורקיה ולמחלוקות ארוכות השנים בין אתונה לאנקרה סביב המרחב האווירי, המים הטריטוריאליים, קפריסין והזכויות במזרח הים התיכון. עם זאת, בשלוש השנים האחרונות מנהלות יוון וטורקיה גם ערוץ הידברות מסודר שנועד לצמצם את סכנת ההסלמה. שר החוץ היווני ציין ביולי כי הדיאלוג כבר הביא לירידה בהפרות המרחב האווירי ולהרחבת המסחר בין המדינות, אף שהמחלוקות העקרוניות לא נפתרו.
כך הפכה ישראל לחלק מוויכוח פנימי רחב יותר ביוון: הממשלה רואה ביחסים עמה מרכיב מרכזי במערך ההרתעה ובמעמדה האזורי של אתונה, בעוד ורופאקיס והשמאל היווני טוענים כי הברית אינה מספקת ליוון ערובה ממשית מול טורקיה, ובמקביל גובה ממנה מחיר מדיני בזירה הבינלאומית.