הפרשה האחרונה החלה לאחר שהתברר כי הרצוג טס מתל אביב לבאקו בטיסה הסדירה J222 של חברת AZAL, במטוס בואינג 787 בשם "שושה". המטוס עבר במרחב האווירי הטורקי, אף שאנקרה אינה מאפשרת למטוסי ממשל ישראליים להשתמש בו. גורם טורקי אמר ל-Middle East Eye כי באקו לא הודיעה לאנקרה שהרצוג נמצא על המטוס. לדבריו, "טורקיה כמובן אינה יכולה לקבל את רשימת הנוסעים של כל מטוס שחולף במרחב האווירי שלה".
החיג'אב, ישראל והעיתונאי הטורקי
אלא שהמחלוקת עמוקה יותר מטיסת הרצוג. מאז סוף ספטמבר מתחוללת באזרבייג'ן מחאה נגד כללי לבוש חדשים בבתי הספר, שיושמו בחלק מהמוסדות כאיסור על חיג'אב. ב-12 באוקטובר דווח כי לפחות 37 מפגינים נעצרו לאחר הפגנות בבאקו ובערים נוספות, וכי תלמידות עם כיסוי ראש לא הורשו להיכנס לכיתות. גם מורות דיווחו כי נדרשו להסיר את החיג'אב או לעזוב את עבודתן.
המתיחות החריפה היום עוד יותר כאשר התביעה האזרית הודיעה כי הוגש כתב אישום נגד העיתונאי הטורקי ג'לאל צ'יפטצ'י, בטענה שקרא ברשתות החברתיות להפלת הממשלה בבאקו בכוח. בית משפט אזרי הוציא נגדו צו מעצר והמדינה ביקשה את סיוע הרשויות בטורקיה.