בהמשך לפיגוע הדקירה שאירע מוקדם יותר היום במלון בקיבוץ צובה, כוחות מג"ב ושב"כ פשטו על בית המחבל שבמחנה הפליטים שועפט בירושלים. במהלך סגירת הכוחות על בית המחבל, חשוד ניסה להמלט ונורה ע״י הלוחמים. החשוד פונה לקבלת טיפול רפואי בבית חולים. הכוחות ביצעו חיפוש ותפסו חומרים ואמצעים טכנולוגיים. בנוסף, עצרו אח של המחבל. כלל הממצאים והעצורים נלקחו להמשך חקירה ביחידה המרכזית של מחוז ירושלים.
בהודעת המשטרה הובהר כי במהלך הפעילות של הכוחות, עשרות חשודים הפרו את הסדר, יידו אבנים וזרקו מטען צינור לעבר הלוחמים, בתגובה לוחמי מג״ב השתמשו באמצעי פיזור.