השר אף קורא תיגר על הקביעה של הרמטכ"ל זמיר באשר להליך הפיקוד והוא יוצא הבוקר נגד הרמטכ"ל באופן ישיר, כאשר הוא קובע שמבקר מערכת הביטחון נדרש להמליץ לו על רף הענישה השוויוני.
"כמו כן, יתבקש המבקר לגבש המלצה לקריטריונים שוויוניים ביחס להסקת מסקנות אישיות. המסקנות יוגשו לי בתוך 30 ימים - וזאת על מנת שאוכל לגבש בהקדם את עמדתי בנושא מינויי הבכירים בצה"ל הנתונים לתחום סמכותי לאור אירועי שבעה באוקטובר. עמדתי ביחס למניעת קידום של מי ששירת בפיקוד הדרום שבעה באוקטובר שרירה וקיימת" אמר השר בהודעתו. השר הוסיף ואמר כי "סוגיית מינוי נספח צבאי לוושינגטון אינה קשורה כלל לנושא ולא מהווה עילה לעיכוב מינוי כלשהו בצה"ל".
חה״כ הרב גלעד קריב מסר: ״ישראל כץ פוגע בבטחון המדינה. בדיוק כפי שהרמטכ"ל, ראש אמ"ן, מפקד פיקוד דרום שכיהנו ב-7.10 לא יכלו להמשיך בתפקידם - כך גם מי שהיה חבר בכיר בקבינט הביטחוני ב-7.10 לא צריך להיות שר הביטחון. בימים של קרב ושל מתיחות ביטחונית ישראל כ"ץ עסוק בקרבות אגו ומאבקי כוח עם עם הרמטכ"ל ומקשה על מסע השיקום הנחוץ כל כך של צה"ל. כ"ץ חוסם מינויים נדרשים, מקעקע את הסמכות הפיקודית של הרמטכ"ל, מתדרך בתקשורת נגד הרמטכ"ל, נותן לגורמים פוליטhים וליח"צנים להתערב בהליכי המינוי בצבא ורומס נורמות בסיסיות ביחסים של הדרג הפוליטי והפיקוד הצבאי. ההתנהלות הזו תביא לפרישה הולכת ומתרחבת של קצינים איכותיים שנמצאים בעתודת הפיקוד של צה"ל. זה כבר קורה. כ"ץ לא מנער את צה"ל (ונדרש ניעור אחרי ה-7.10) - הוא מחליש אותו ופוגע בו".