למרות החלטת ראש הממשלה בנימין נתניהו למנותו לראשות המוסד, בתקופה האחרונה העריכו במערכת הביטחון כי המזכיר הצבאי של ראש הממשלה, האלוף רומן גופמן, לא יוכל להתמנות לראשות המוסד במקום דדי ברנע, וזאת בשל העובדה כי טרם הושלמה הבדיקה בנוגע להתנהלותו בפרשת מעצרו של הנער אורי אלמקייס מאשקלון.
אלמקייס, אז נער בן 17, הופעל על ידי גופמן, ששימש אז כמפקד אוגדה 36, וכן על ידי אנשי מודיעין וסייבר במסגרת מבצע להשפעה והפעלת סוכנים נגד גורמי טרור אסלאמי, כולל חיזבאללה, איראן וגורמים ביהודה ושומרון. לאחר שנחשד בפרסום ידיעות סודיות, נעצר אלמקייס במאי 2022 במעצר שווא על ידי השב"כ והמשטרה, עבר חקירות ועינויים, ופרקליטות המדינה הגישה נגדו כתב אישום חמור. רק לאחר כשנה וחצי הצליח אלמקייס להוכיח את חפותו, וגורמי מודיעין בצה"ל התנערו מאחריות. שמו היה תחת איסור פרסום, שהוסר בינואר 2025.
התרעות פיקוד העורף