מורשתו של מוג'תבא עצמו רוויה בדם. אם עלי חמינאי נחשב למנהיג נוקשה שסירב להתגמש בסוגיות גרעין ודיכא באלימות את בני עמו, הרי שבנו נתפס כקיצוני ואכזר אף יותר. במשך שנים נטען מצד פעילי אופוזיציה וגורמים רפורמיסטיים כי מוג'תבא היה המוח מאחורי הדיכוי האכזרי של "התנועה הירוקה" לאחר הבחירות השנויות במחלוקת לנשיאות בשנת 2009. חמור מכך, על פי הדיווחים הוא זה שניהל בפועל את גל הדיכוי והטבח ברחובות איראן בחודש ינואר האחרון - התקוממות עממית שקראה לסיום שלטון אביו. ארגוני זכויות אדם מעריכים כי כוחות הביטחון, תחת הנחיותיו של מוג'תבא, רצחו אלפי אזרחים איראנים במהלך דיכוי המחאות, כאשר המספר הסופי צפוי להיות גבוה בהרבה.
על רקע המינוי: המעורבות של מוג'תבא חמינאי ברצח עשרות האלפים ברחובות איראן נחשפת
יוצאים לארוחת החג? אלה הכבישים שכדאי להימנע מהם
הכוננות לא יוצאת לחג: צה"ל נערך לתרחיש הסלמה מול איראן
שלושה במחיר של אחד: בכיר חמאס חוסל בח'אן יונס — והוא לא היה שם לבד | צפו בתיעוד
26 גדודים ותרגיל מיוחד: צה"ל נערך לחגי תשרי באיו"ש
"לא האמנתי שהם יעזו": ההפתעה האיראנית – והסוד של החץ שניצח אותה