פעילות זו מזעזעת את המוסד זעזוע עמוק, אם כי לא בהכרח שלילי. יש כאלה הסבורים ש"הגיע הזמן לקרוא תיגר על כל הנחות היסוד הישנות ולהתחיל מהתחלה, בעיקר לאחר הכישלון של המוסד בנושא האיראני". ויש כאלה, כמובן, שסבורים שמדובר בפעלתנות יתר שתסתיים בלא כלום, למעט בזבוז של זמן יקר ואנרגיה.
גופמן הקים לעצמו "מועצת חכמים" של יועצים חיצוניים, שאינם אנשי מוסד לשעבר, ומגבשת עבורו שורה של המלצות בתחומים שונים: משימות המוסד, דרכי הפעולה, הקצאת משאבים וכו'. מדובר בחמישה אנשים שלא שירתו במוסד, ותפקידם ללמוד את דרך הפעולה ודרך ההפעלה של הארגון ולחשוב על הכל מחדש. "מכיוון שאי אפשר לקחת למוסד חברת ייעוץ חיצונית, זה הדבר הכי קרוב לזה", אמר גורם המקורב לסיפור.
החמישייה מסתובבת בתוך מטה המוסד ואגפיו השונים באופן חופשי. "זה מטריף את ראשי האגפים ובכירים נוספים", אמר אתמול מישהו שבקיא בעניין, "הם נמצאים בכל מקום, הם יושבים עם גופמן גם בדיונים אסטרטגיים, אף אחד לא יודע איך לאכול את זה, במוסד יש מסורת של חשאיות ודיסקרטיות, אין דריסת רגל לגורמים חיצוניים, פתאום הדבר הזה".
גופמן פועל כדי למנות לכל ראש אגף ובעל תפקיד בכיר במוסד "צל", כנהוג בצה"ל. הכוונה למישהו שנשא בתפקיד בעבר ומשמש יועץ, סגן ו"יד ימין" של נושא התפקיד. סוג של מ"מ מפקד, הפועל תחתיו ובהנחייתו, אבל מוסיף את הניסיון המצטבר שלו. בצה"ל הנושא מוכר ושגרתי, בעיקר בעיתות חירום ומלחמות. במוסד זה לא היה נהוג מעולם.
השאלה היא מה צריך המוסד לעשות חוץ מאיראן. גופמן לא מקבל את המצב הנוכחי וחושב שצריך לתכנן מחדש את המשימות ואת דרכי הפעולה של המוסד, לחשב מסלול מחדש, להוסיף תחומי פעילות ולבטל תחומים מיותרים. כך, למשל, נשקלת האפשרות להפעיל את המוסד גם נגד הדה-לגיטימציה של ישראל בעולם.
בנושאים אחרים, שבהם פעיל המוסד שנות דור, נבדקת האפשרות לבטל את הפעילות הזו. גופמן בודק גם את מבצעי המוסד ואת הדרך לאישור מבצעים והפעלתם. על פי כמה גורמים, הוא כבר הספיק לבטל מבצעים שהיו בדרך לביצוע, כי לא היה מרוצה מהמטרה, מדרך הפעולה או מהנחיצות.