בית המשפט הצבאי גזר עונשים של 21 שנות מאסר ו-17 שנות מאסר על שני מחבלים שהיו חלק מהחוליה שביצעה את הפיגוע בו נרצח דני גונן ז"ל. השניים הורשעו במסגרת הסדר טיעון בעבירות של סיוע לגרימת מוות בכוונה וניסיון לגרימת מוות בכוונה, עבירות המקבילות לעבירת סיוע וניסיון רצח בישראל ובעבירות ביטחון נוספות.
על המחבל מחמד חוסיני אבו שאהין נגזרו בינואר 2017 שני מאסרי עולם בגין גרימת מותו בכוונה של דני גונן ז"ל ופציעתו של אחר.
התרעות פיקוד העורף