בחוות הדעת קובע מאור כי "צים החדשה אינה פגיעה באינטרס הלאומי, נהפוך הוא. מדובר בשדרוג אסטרטגי וחסר תקדים". עוד הוא כותב כי ההתנגדות לעסקה "נשענת על נרטיב פופוליסטי, ניתוח חסר של מרכיבי הסחר הימי הלאומי והבינלאומי, והתעלמות מהעובדה שמרביתו של צי 'צים הישנה' כיום נמצא בבעלות זרה ומבוזרת".
לדבריו, חלק ניכר מהביקורת הציבורית על העסקה מתבסס על תפיסות שאינן משקפות את מבנה הבעלות והפעילות של צים כיום. בעוד שרוב מניותיה של צים מוחזקות כבר כיום בידי משקיעים זרים באמצעות המסחר בבורסת ניו יורק, "צים החדשה" תהיה בבעלות ישראלית מלאה, בשליטת קרן פימי, שלדבריו "מוניטין בעליה בהיבט הלאומי/פטריוטי מוכח והינו מעל לכל ספק", ותפעל מתוך מחויבות מלאה לצורכי המדינה, לביטחון הלאומי ולרציפות הסחר הימי.
מאור מצביע על כך שאחד השינויים המרכזיים הוא מיקוד פעילות החברה ב"קווי הבית" של ישראל. בעוד שהצי הגלובלי של צים פועל ברובו באזורים מרוחקים בעולם, אוניות "צים החדשה" יפעלו בעיקר בים התיכון ובאוקיינוס האטלנטי, יפקדו באופן שוטף את נמלי ישראל ויעמדו לרשות המדינה בזמינות גבוהה יותר בעת חירום. לדבריו, מודל זה יחזק את רציפות הסחר הימי ואת יכולתה של ישראל להתמודד עם מצבי משבר.
בחוות הדעת מודגש גם היתרון המשמעותי בתחום ההון האנושי. מאור קובע כי "צים החדשה" צפויה להגדיל באופן משמעותי את מספר התקנים לקברניטים ולקציני ים ישראלים, ולהיות שותפה פעילה בהכשרת הדור הבא של אנשי הים באמצעות השקעה במכון להכשרה ימית בעכו. לדבריו, מהלך זה יחזק את עתודת כוח האדם הימי של ישראל, שנשחקה לאורך השנים.
בהיבט הכלכלי מציין מאור כי החברה החדשה צפויה להתחיל את פעילותה עם צי אוניות מודרני, ללא חוב, ותיהנה מהסכמים מסחריים עם Hapag Lloyd שיספקו לה יציבות בשנות פעילותה הראשונות, גם בתקופה של תנודתיות בענף הספנות העולמי.
מאור מתייחס גם לטענות שלפיהן העסקה מצמצמת את צי האוניות של צים, ומסביר כי מרבית האוניות המופעלות כיום אינן בבעלות החברה אלא מוחכרות. לדבריו, "צים החדשה" תחזק את האינטרס הלאומי באמצעות שישה נדבכים מרכזיים: בעלות ישראלית מלאה שתמנע השפעה זרה, מיקוד פעילות הצי ב"קווי בית" ובקרבת נמלי ישראל, הגדלה משמעותית של מספר התקנים לקציני ים ישראלים, שותפות אסטרטגית בהכשרת דור העתיד של הימאים, צי מודרני ללא חובות ובגיבוי הסכמים מסחריים, והמשך מחויבות מלאה למניית הזהב ולעדכונה בהתאם לצורכי המדינה.
בין היתר כותב ד"ר מאור: "הצי שבבעלות 'צים החדשה' בקווי הבית כפוף באופן מלא לחוקי החירום והגיוס הישראליים. אין גם צורך להכביר במילים על מחויבותה של קרן פימי לסעיפי מניית הזהב ולהמשכיותם בתקנון 'צים החדשה'. סעיפי מניית הזהב, שנוסחו לפני עשרות שנים בעת הפרטת חברת צים הממשלתית, זקוקים לריענון ולעדכון שיתאימו לצורכי מדינת ישראל של היום".
תגובת ועד עובדי צים לחוות הדעת של ד"ר יגאל מאור: "ועד עובדי צים דוחה בשאט נפש ועל הסף את חוות הדעת של ד"ר יגאל מאור. מדובר בניסיון שקוף להכשיר מהלך פיננסי הרסני, נטול כל היגיון כלכלי, במסווה של 'שדרוג אסטרטגי' לכאורה. לא מפתיע שחוות דעת שממומנת ומוזמנת ישירות על ידי קרן פימי, הגוף בעל האינטרס הכלכלי הצר והמובהק ביותר באישור העסקה מנסה לצבוע מהלך מסוכן בצבעים פטריוטיים".
עוד אמרו: "מילים יפות על 'ציונות' ו'מוניטין' אינן יכולות להחליף מודל עסקי בר-קיימא, ואינן יכולות להסתיר את הסיכונים הדרמטיים הבאים: איום בבעלות קטארית: בכל העולם מבינים כיום את הסכנה האסטרטגית החמורה בכך שחברת הספנות הלאומית של ישראל תעבור בפועל לידי ענקית ספנות זרה, שחלק משמעותי ממניותיה וזכויות ההצבעה בה מוחזקות בידי גורמים מקטאר וסעודיה. הפקדת השליטה בנתיבי האספקה של ישראל בידי גורמים אלו היא הפקרות ביטחונית. פגיעה אנושה ברציפות התפקודית בחירום: אין שום סיכוי שחברה קטנה ומצומצמת של מספר אוניות בודדות (כפי שמציע מתווה 'צים החדשה') תוכל לתת מענה אמיתי ומקיף לצרכי המשק הישראלי, להובלת תחמושת, מזון וציוד חיוני בשעת חירום. מדינת ישראל זקוקה לצי חזק וגדול לא למיזם מדולל".
לסיום, אמרו: "הנדסת תודעה כלכלית: לעסקה הזו אין שום הצדקה עסקית לחברה או לעובדים, והיא מסכנת באופן ישיר את היציבות הפיננסית של נכסי צים ואת עתידם המקצועי של מאות עובדיה. החוסן הלאומי האמיתי של מדינת ישראל בים נשען על יציבות עסקית ועל עובדים מסורים, לא על חוות דעת מטעם. ועד העובדים ימשיך לעמוד כחומה בצורה מול מהלכים חד-צדדיים וחסרי אחריות. לא נאפשר לפגוע בחברה ובביטחון המדינה לטובת רווחים מהירים של גורמים חיצוניים".