בעקבות כך פנה בא כוחו של נבון, עו״ד יוסי בן חמו, למבקר המדינה וביקש את הגנתו מפני התנהגות שרירותית של הנהלת עמידר. בתגובה, התחייב ממלא מקום מנכ״ל החברה, יוסי אבוטבול, כי החברה תפעל על פי הוראות המבקר ותימנע מנקיטת צעדים חד־צדדיים. אולם למרות זאת, העדיפה עמידר להתעלם מההתחייבות למבקר וכבר בחרה במועמד אחר שיחליף את נבון בתפקיד. המבקר הביע את התרעמותו ודרש מהחברה שלא לנקוט בצעדים חד־צדדיים כל עוד הנושא נמצא בטיפולו.
אגב, מכתבו של המבקר שוגר לראובן קפלן, שהוגדר ״כמנכ״ל החברה״, ואולם מבדיקת ״מעריב־השבוע״ עולה כי קפלן נבחר אומנם לתפקיד המנכ״ל על ידי ועדת האיתור, אך הוא עדיין לא מונה באופן רשמי לתפקיד, שכן המינוי כפוף לאישורם של שרי האוצר והשיכון. נראה כי פרשת נבון ונושאים אחרים הנוגעים לענייני הדיור הציבורי יטופלו על ידי קפלן מיד עם כניסתו הרשמית לתפקיד.
התרעות פיקוד העורף