כמו בציונות הדתית, גם יהדות התורה עמדה בפני פיצול וריצה ברשימות נפרדות של המפלגות המרכיבות אותה - אגודת ישראל ודגל התורה. בסופו של דבר, בתיווכו של בנימין נתניהו, הוחלט לרוץ ביחד, בין היתר בשל החשש מאחוז החזימה, כשמשה גפני מדגל התורה מפנה את המקום הראשון ליצחק גולקנופף מאודת ישראל. 

רשימת יהדות התורה לכנסת ה-25

1. יצחק גולדקנופף
2. משה גפני
3. מאיר פרוש
4. אורי מקלב
5. ישראל אייכלר
6. יעקב אשר
7. יעקב טסלר
8. יצחק פינדרוס
9. משה רוט
10. אליהו ברוכי