גם אם כן בוצעו פיגועי טרור על ידי ערבים ישראלים, האחרונים לרוב תפקדו כסייענים של טרוריסטים פלסטינים שבאו משטחי יהודה ושומרון. לרוב היה מתאם בין מעורבות ערבים ישראלים בטרור לבין תקופות של מתיחות ביטחונית או משבר ביטחוני מול הפלסטינים ביהודה ושומרון. כך, בתקופת האינתיפאדה השנייה נרשמה עלייה במעורבות ערבים בישראל בטרור, וגם הפיגוע החמור שביצע המחבל נשאת מלחם בדיזנגוף שבתל אביב בינואר 2016 הגיע על רקע גל טרור היחידים שפקד את ישראל באותה התקופה מצד פלסטינים שהגיעו משטחי הרשות.