בפתח הדיון הוצג השופט אהרן ברק, שהצטרף מטעם ישראל לצוות השופטים בדיון. ברק הושבע לדיון והצהיר: "אני מצהיר בזאת שאמלא את סמכויותיי כשופט בכבוד ובאמונה ללא משוא פנים ומתוך מצפון מלא".
לקראת הדיון יצאה צעדת הזדהות ישראלית בדרכה אל בית הדין, בהובלת משרד החוץ. במהלך הצעדה התרחשו עימותים עם מפגינים פרו פלסטינים שהגיעו מוקדם יותר לתמוך בתביעה נגד ישראל.
נציג דרום אפריקה אמר בדיון כי "ישראל מכפיפה את העם הפלסטיני למשטר אפרטהייד, ומבצעת רצח עם בפלסטינים". שר המשפטים של דרום אפריקה הוסיף: "ישראל מטילה מצור ארוך שנים על עזה, ומונעת כניסה ביבשה ובים. היא יישות כובשת".
טענות דרום אפריקה התמקדו גם במצב ההומניטרי ברצועה: "93% מהאוכלוסיה סובלת מרעב חמור. מכל האנשים בעולם, שסובלים בימים אלו מרעב – יותר מ-80% נמצאים בעזה. מומחים צופים שיותר עזתים ימותו מרעב וזיהומים מאשר מהתקיפות של צה"ל. ישראל חוסמת העברת ציוד רפואי לצרכי חירום". בנוסף, טוענת דרום אפריקה, כי ישראל ביצעה פשעי מין בילדים ובנשים וחוטפת תושבים.
"ח"כים חזרו וקראו למחיקה, חיסול, שיטוח והריגה של כל כל תושביה", הוסיף הנציג. "המחוקקים קראו להפצצות חסרות רחמים, כשחלקם מציעים 'נכבה יותר גדולה מ-1948'".
לדבריה, "כ-8,000 משפחות נקטלו באופן מכוון, חלקם נתגלו בקברי אחים, ואחרים נרצחו ב'אזורים המאובטחים' לכאורה שאליהם כוונה אותם ישראל. רוב ההרוגים נשים, ילדים ותינוקת בני יומם. הכל בכוונת תחילה. 60 אלף פצועים ושבויים, הושפלו, הופשטו מבגדיהם ונלקחו לכוון לא ידוע. עקירת האנשים מבתיהם והעברתם לדרום נעשו למטרות ג'נוסייד. חיילים הניפו דגלי ישראל ומתנחלים אמרו כי יבנו שם התנחלויות".
התרעות פיקוד העורף