בקשר למחלוקת סביב קבלת הפרס, ותמיכתו לכאורה במטרותיה של התנועה לחרם על ישראל, ה-BDS, אמר המדען: "שוב ושוב - המסמך אינו קורא להחרים את ישראל אלא מסביר שהביקורת החריפה של ארגונים שונים – ובכללם ה-BDS – על מדיניות ישראל בשטחים הכבושים והקריאה לסנקציות כלפיה בשל מדיניות זו אינה אנטישמיות, אלא ביקורת לגיטימית ופעולה פוליטית לגיטימית. אני עומד מאחורי חתימתי על מסמך זה".
טרם הסערה, החליטה הוועדה להעניק את הפרס לגולדריין על פועלו המחקרי בנושא סיבוכיות חישובית. השר גלנט גילה כי גולדרייך חתום על פנייה לפרלמנט הגרמני לבטל את ההכרה בתנועת החרם על ישראל, ה-BDS, כתנועה אנטישמית. בנוסף גילה גלנט, כי הפרופ' גם הגדיר את חיילי צה"ל כפושעי מלחמה. יצוין כי בג"ץ קבע בעבר כי לשר החינוך אין כל סמכות להתערב בהענקת הפרס, או לקשור בין התבטאויות כגון אלו לבין מתן הפרס.
התרעות פיקוד העורף