המבנה ההיסטורית של הקונסוליה ישתנה כעת ויהפוך ליחידה לענייני פלסטינים, ויפעל בחסות השגרירות. עד כה פעלו שתי הישויות - השגרירות כשהייתה ממוקמת בתל אביב, והקונסוליה הכללית בירושלים - כשתי יחידות נפרדות, כאשר כל אחת מהן דיווחה באופן עצמאי למחלקת המדינה, כל אחת מהן בעלת דוברת אחרת.
השגרירות בתל אביב הייתה אחראית על חלקה של ישראל בתוך הקו הירוק של 1967, והקונסוליה הכללית הייתה אחראית על הגדה המערבית, עזה ומזרח ירושלים. יחידת העניינים הפלשתיניים החדשה צפויה לבצע רבות מהמשימות שעד כה בוצעו על ידי הקונסוליה הכללית, אם כי חלק מפעילות היחידה יועברו לבניין השגרירות החדש בירושלים.
התרעות פיקוד העורף