עוד אמר נתניהו כי: "במהלך השנים נטל חלק בחיים הציבוריים, היה שר בממשלת ישראל ופעל להחזרת הרכוש היהודי שנלקח בשואה. הוא היה ידיד אישי קרוב של משפחתנו. לא היה שני לו בחוכמה, בשנינות ובמחויבות אין קץ לעם ישראל ולמדינתנו. אנו מבכים את לכתו".
גם יו"ר הכנסת יולי (יואל) אדלשטיין ספד לאיתן: "בשם כנסת ישראל אני מצר על פטירתו של חבר הכנסת לשעבר, איש המודיעין רפי איתן. מחויבותו ותרומתו לתקומת ישראל, ביטחון המדינה ובפרט למבצע לכידתו של הפושע הנאצי אייכמן יזכרו לנצח בהיסטוריה של עם ישראל. יהי זכרו ברוך".
שרת התרבות והספורט מירי רגב מסרה אף היא: "הצטערתי לשמוע על פטירתו של השר לשעבר ואיש קהילת המודיעין במשך שנים ארוכות רפי איתן ז"ל. הוא ייצרב בזיכרוננו כאיש שפיקד על המבצע לתפיסתו של צורר היהודים אדולף אייכמן והביא אותו למשפט צדק בישראל. תרומתו הרבה לביטחון מדינת ישראל במבצעים רבים עליהם פיקד ובהם נלחם, לא תסולא בפז. אני שולחת תנחומים כנים לבני משפחתו. שיהיה שבוע טוב ובשורות טובות לכל עם ישראל".
התרעות פיקוד העורף