בחירת ליבו של פולארד היא רבקה אברהמס-דונין, והחתונה התקיימה בבית הכנסת "היכל יעקב", בשכונת קריית משה שבירושלים. האירוע התקיים במעמד המשפחה המצומצמת וחברים קרובים.
פולארד עצמו מסר: "מרגש מאוד להתחתן כאן בירושלים עיר הבירה הנצחית של העם היהודי, אני מתרגש מאוד ומודה לכל עם ישראל ששמח יחד איתנו".
הרב שלמה עמאר שליט"א אמר בפתח החופה: "אף שאני עורך חופות רבות, איני זוכר פעמים שהתרגשתי כמו במעמד הזה. כולנו, עם ישראל, חייבים ליונתן היקר כל כך הרבה ואולי יום אחד נדע עוד על מסירות נפשו שלא נמשכה רגע אחד, אלא עשרות שנים של ייסורים קשים בכלא שמהם לא רק שלא נפלת אלא עוד יצאת אדם טוב ומרומם עוד יותר משום שעבדת ועמלת על כך. אני מברך את הכלה היקרה ואותך שביתכם יהיה מלא באהבה, מלא בשמחה".
התרעות פיקוד העורף