החטופים נבדקים כעת במרכז לרפואה דחופה בשיבא. עשרות קרובי החטופים מתגודדים מחוץ לחדר המיון של המרכז הרפואי שיבא במחיאות כפיים וקריאות ״עם ישראל חי״. פקק ארוך נוצר בכניסה למרכז הרפואי כשהמונים מנסים להיכנס ולעודד את משפחות החטופים ששבו.
על פי נוהל משרד הבריאות הטיפול בחטופים מתבצע במתחמים נפרדים. כל חטוף מקבל חדר משלו כשהוא מלווה על ידי אחות, רופא, ועובדת סוציאלית. תחילה עוברים כל חטופה וחטוף בדיקה גופנית כללית הכוללת בחינה של המצב הכללי, פציעות פגיעות ושטפי דם, ובדיקה פיסית מכף רגל ועד ראש.
החטופים עוברים גם בדיקות דם כלליות הכוללות לרוב ספירת דם שנועדה לאתר מצב זיהומי, ירידה בהמוגלובין אם בשל מחסור בברזל או דימומים, מצב טסיות הדם, בדיקת כימיה הכוללת נתונים על חסרים תזונתיים או חסר במלחים בגוף, תפקודי הכבד והכליות, ובדיקות דם נוספות המאתרות מחסור בוויטמין D, וויטמין השמש – החשוב לפעילויות רבות בגוף ורמתו יורדת לאחר חודשים רבים כל כך באפלה, לצד רמות וויטמינים ומינרלים נוספים. החטופים עוברים גם בדיקות אורתופדיות, ובמקרה הצורך גם צילומי רנטגן או בדיקות CT.
חטופים הסובלים ממחלות כרוניות עוברים בנוסף בדיקות כלליות על ידי רופא מומחה. על פי הידוע חלק מהחטופים הגיעו לשבי כאשר הם לוקים במחלות כאלה, והרופא המומחה צפוי לדרוש בדיקות מעקב דחופות שיוודאו האם חלה הידרדרות בחומרת מחלתם. כמו כן יותאמו להם מחדש התרופות שלא קיבלו במהלך השבי.
בדיקות החטופים כוללות גם בדיקה דיסקרטית לאפשרות של פגיעה מינית. זו כוללת בדיקת גינקולוג, ואיסוף דגימות שעלולות להחשיד לתקיפה כזו. החטופות יעברו ככל הנראה גם בדיקת היריון.
במהלך כל התהליך מתלווה לכל חטופה וחטוף גם עובדת סוציאלית של בית חולים כדי להתרשם מעוצמת המצוקה הנפשית. על פי הצורך נקראים לבדיקה גם פסיכיאטר או פסיכולוג. הליווי הנפשי והסוציאלי של החטופים נמשך לכל משך האישפוז וגם לאחר שחרורם. בני המשפחה של החטופים מתבקשים גם להביא לשהות בבית החולים חפצים אישיים – בגדים, ספר, נעליים, מזון אהוב, וכל דבר שיסייע להם לשוב אל החיים האמיתיים.
התרעות פיקוד העורף