הצעת החוק מבקשת לאפשר הטלת עונש מוות במקרים של פעולות טרור קשות, ומעלה שאלות מעשיות על אופן ביצוע ההליך ועל הגופים שיידרשו להיות מעורבים בו. ההסתדרות הרפואית, הארגון המקצועי המייצג את כלל הרופאות והרופאים בישראל, פרסמה מסמך עמדה חד משמעי המתנגד לכל מעורבות של גורם רפואי בתהליך.
עוד נכתב: "בהתאם לכך, כאמור, חל איסור מוחלט על רופאים ישראלים להשתתף באופן פעיל או פסיבי בהוצאות להורג, לרבות הערכת כשירות, מעורבות בהזרקת חומרים, ניטור סימנים חיוניים או מתן ייעוץ טכני.
"עמדה זו נשענת על העיקרון הבסיסי של המקצוע הרפואי, הקובע שרופא נועד להציל חיים, להפחית סבל ולשקם את המטופלים. ההסתדרות הרפואית מזכירה כי שבועת הרופא העברי מציבה את קדושת חיי האדם בראש סולם הערכים.
"בתוך כך היא מזכירה את המשפט 'ושמרתם עד מאוד חיי האדם מרחם אמו והיה שלומו ראש חרדתכם כל הימים', המסמן את התפקיד הראשוני של העוסקים ברפואה. ההסתדרות מדגישה כי ערך זה אינו יכול לדור בכפיפה אחת עם השתתפות בהליך משפטי שמטרתו נטילת חיים.
"העמדה בישראל מתיישרת באופן מלא עם קביעות ההסתדרות הרפואית העולמית WMA. הארגון העולמי קבע בשורה של החלטות כי השתתפות רופאים בעונש מוות פסולה מכל בחינה מוסרית. בהחלטה הרלוונטית מצוין כי רופא אינו יכול לקחת חלק אפילו בשלבים טכניים או ייעוציים של ההליך, לרבות הדרכה, הכנה או מעקב אחר מצב פיזיולוגי של הנידון. על פי ההחלטה, שימוש בידע רפואי שלא למטרת ריפוי ושיקום פוגע ביסודות האתיים של המקצוע".
במערכת הבריאות בישראל מציינים כי קידום ההצעה עלול להציב רופאים בסיטואציה בלתי אפשרית. מצד אחד, החוק עשוי לדרוש פיקוח רפואי כדי לעמוד בסטנדרטים משפטיים ובינלאומיים. מצד שני, האתיקה הרפואית אוסרת לחלוטין כל מעורבות של גורם רפואי.
לדברי גורמים משפטיים, בחלק מהמדינות המפעילות עונש מוות נדרשת נוכחות רופא, בין אם לצורך בדיקת כשירות או לצורך קביעה רשמית של מוות. בישראל, ההסתדרות הרפואית מציבה אם כן קו ברור: רופאים לא ייקחו חלק בכך בשום תנאי.