חואגרי נתפס כשנה וחצי לאחר תחילת הפלישה והובא לחקירות והליך משפטי בישראל. הוא חשוד שביצע מעשי רצח בדרך של התעללות מיוחדת, בין היתר של חסרי ישע, רצח במסגרת ארגון טרור, הסתננות מזוינת, מעשה טרור המוני, עבירות מין, חטיפה לשם רצח או סחיטה, הצתה במטרה לפגוע בבני אדם, הדחה למעשה טרור מזוין וחברות בארגון טרור על כל המשתמע מכך, עבירה הכוללת ביצוע אימונים, עבירות נשק, מתן שירותים לארגון טרור ועוד.
ימיני אמר כי לפי התקנות האמורות ולאחר שהוא מצא כי קיים יסוד סביר לחשד ועילת המעצר, יוארך מעצרו של האיש והממונה על המעצר יאפשר ביקורי עורך דין בהתאם למדיניות שירות בתי הסוהר. הבקשה להארכת המעצר נובעת מהסיכון הנשקף מהמחבל למדינה וכן מהאפשרות שהוא ינסה לשבש את הליכי החקירה והמשפט.
התרעות פיקוד העורף