גם מדד השחיתות השנתי של ארגון "שקיפות בינלאומית" לשנת 2013 מצא כי המוסדות המושחתים ביותר בפורטוגל הם המפלגות, הפרלמנט, מערכת המשפט והצבא. מנהל הסניף הפורטוגלי של הארגון, ג'ואו בטליה, הביע ספק אם החקירות האחרונות, אף שהן זוכות לתהודה גדולה, ישנו את התמונה. "החקירות הקשורות לכלכלה, לפיננסים ולשחיתות הביאו למעט מדי כתבי אישום, וכתבי האישום הללו הביאו להרשעות מעטות, וההרשעות הללו לא הביאו לעונשי מאסר רבים", אמר לאתר החדשות "יורוניוז". "לכן יש בעיה רצינית של חוסר יעילות של מערכת המשפט".