על פי כתב האישום, שהוגש באמצעות עו"ד ניצן שפיר מפרקליטות מחוז תל אביב, בימים שלפני הפיגוע, שהה חליל בדירה בה מתגורר אחיו, בבניין פנורמה בתל אביב. הימים האלה, החליט הנאשם לרצוח יהודים באמצעות סכין, בתקווה שלאחר ביצוע הרצח יומת ויזכה למעמד של "שהיד". בבוקר הרצח, נטל סכין ממטבח מסעדה בקומת הקרקע בבניין פנורמה והחל בחיפוש אחר קורבנות. חליל עלה לקומה השנייה, שם רצח את ראובן אבירם ז"ל אשר נקרה בדרכו, ואת אהרון יסייב ז"ל, אשר התפלל אותה עת תפילת מנחה, "בדקירות סכין מרובות ואכזריות, בעיקר בפלג גופם העליון". יסייב איבד מיד את הכרתו ומותו נקבע במקום האירוע ואבירם פונה לבית החולים ללא דופק ומותו נקבע עם הגעתו לבית החולים.
כתב האישום ממשיך ומגולל כיצד הנאשם ניסה לרצוח אזרחים נוספים, תוך שהוא מנסה להיכנס לבתי עסק בקומה השנייה בבניין, אך האזרחים שנכחו במקום הסתגרו בבתי העסק ולא אפשרו לו להיכנס. הוא המשיך בחיפוש אחר קורבנות נוספים וירד לשם כך לקומה הראשונה בבניין, נכנס למחסן נעליים, העסק הראשון שנקרה בדרכו. שם דקר באכזריות עובד בעסק בפלג גופו העליון, תוך שהעובד נאבק בו. בסמוך לכך, הגיע למחסן הנעליים אזרח שנכח במקום שעקב אחר הנאשם מהקומה השנייה כשהוא מצויד במוט ברזל והכה את חליל באמצעות המוט על מנת לגרום לו לחדול ממעשי הדקירה. אל האזרח הצטרפו עובדי מחסן הנעליים וכולם יחד הצליחו להשתלט על הנאשם ובכך מנעו ממנו לרצוח את העובד. כתוצאה מהדקירות נגרמו לעובד פציעות רבות. הוא פונה לבית החולים איכילוב לטיפול רפואי ונזקק לאשפוז.
בחקירתו במשטרה הודה חליל כי החליט לרצוח יהודים בשל היותם יהודים, על מנת שבמהלך מעשי הרצח יומת ובכך יהפוך לשהיד. הוא תיאר את מסע הרצח ושיחזר אותו במקום האירוע. הפרקליטות הגישה לבית המשפט גם בקשה לעצור את חליל עד תום ההליכים המשפטיים נגדו. בבקשה נכתב כי "אין צורך להכביר מילים אודות חומרת מעשי המשיב. מעשי הרצח בוצעו באכזריות קשה ומזעזעת, כשהמשיב דוקר פעם אחר פעם את קורבנותיו. מסע הרצח האכזרי נפסק אך בשל תושייתם של האזרחים, אשר התערבו ומנעו מהמשיב להמשיך את מסע הקטל".
התרעות פיקוד העורף