כאמור, לאחר הביקור בבית החולים, התחיל פינטו לרצות שנת מאסר אחת בגין הרשעתו בפרשת הרב-ניצב. פינטו אמור היה להיכנס לכלא מעשיהו ברמלה לאחר שכל ניסיונותיו להימנע ממאסר בפועל עלו בתוהו, אך בשל מצבו הרפואי הקשה הוא הגיע למרכז הרפואי של שב"ס בכלא ניצן, אף הוא ברמלה.
את הערב האחרון שלו כאדם חופשי בילה הרב פינטו בהעברת שיעור תורה לחסידיו בקהילת "שובה ישראל" באשדוד, שבראשה הוא עומד."יש לנו ביטחון ואמונה חזקים ביותר", אמר על מאסרו הצפוי. "הקדוש ברוך הוא לא נותן לאדם מבחן שהוא לא יכול לעמוד בו. אנחנו צריכים להיות בשמחה גדולה. לא שוברים את הרוח שלנו. אנחנו לא חושבים על מחר אפילו רגע אחד. מחר זה כמו היום וכמו שלשום וכמו לפני חודש ולפני שנה".
בית המשפט גזר על פינטו שנת מאסר בפועל ובית המשפט העליון דחה את ערעורו על העונש וכן את בקשתו לדיון נוסף בהרכב מורחב. שב"ס ייאלץ להתמודד מהיום גם עם החזקתו במאסר של רב ידוע שבריאותו לקויה.