לפי מקורות במשטרה, שבתאי זעם על בן גביר שצלצל לאותו מפקד מג"ב ללא אישורו ועדכונו. כמו כן, שבתאי כעס על הודעת השר, בה הוא ומפקד מג"ב החליטו להשעות את השוטרים, בזמן שהוא קיבל החלטה בעניינם עוד טרם לכן. במשטרה אף טענו שהפעולה של השר לביטחון לאומי היא התערבות בנושא מבצעי דבר שאסור לו.
ממשטרת ישראל נמסר בתגובה: "לאור האירועים שאירעו במירון הערב, פנה השר לביטחון לאומי למפקד משמר הגבול באופן ישיר וללא עדכון מקדים של המפכ"ל בנושא השעיית הלוחמים מהאירועים במירון. על מנת להעמיד דברים על דיוקם, בהחלטת מפכ"ל המשטרה, השוטרים לא הושעו אלא הורחקו מפעילות מבצעית עד לסיום הבירור בעניינם. בהקשר לכך ונוכח העובדה שמדובר בהתערבות של השר באירוע קונקרטי, בניגוד להחלטות בג"ץ, עדכן המפכ"ל את היועצת המשפטית לממשלה על אופן ההתנהלות האמורה".