כמו כן, במערכת הביטחון דוחים בתוקף את הטענות על חקירה אגרסיבית כנגדו ואומרים כי פלדשטיין הוחזק במתקן השב"כ לצורכי החקירה, וכי כבר לפני שבוע הוא הובל למתקן של שב"ס לאחר שהחקירה הביטחונית בעניינו הסתיימה, והחקירה הפלילית של משטרת ישראל עסקה בעניינו.
לדברי גורם במערכת הביטחון, בכל שלבי החקירה בשכ"ב ואח"כ במשטרת ישראל, לא העלה פלדשטיין כל טענה על יחס או אמצעי חקירה שחורגים מהנורמות המקובלות, וכל זכויותיו נשמרו כעצור. גורמים ביטחוניים אומרים כי חקירת השב"כ בפרשת נפתחה לאחר שהועלה חשד לדלף מידע סודי מצה"ל. השב"כ אמון על פי חוק לחקור ולמנוע דלף מידע סודי מצה"ל, וכך נעשה גם בחקירה זו.
בהחלטה שקיבל נשיא בית משפט השלום בראשון לציון, להתיר את פרסום פרטי החקירה ואיסור פרסום שמות המעורבים האחרים בפרשה, נכתב כי מי שהוציא את המסמך הסודי על דעת עצמו היה נגד במילואים, שמעצרו הוארך גם כן.
התרעות פיקוד העורף