1,500 לוחמי כליאה, יחידת נחשון ואנשי סגל של שירות בתי הסוהר (שב"ס) נערכים מבצעית וכלואתית ליישום הליך שחרור המחבלים הכלואים בהתאם למתווה המדיני שהוסכם להשבת החטופים. בשעות הצהריים קיבל שב"ס את רשימת 90 האסירים שישוחררו, בהם 78 תושבי איו"ש ו-12 תושבי מזרח ירושלים.
עוד בטרם ישוחררו, עוברים האסירים הביטחוניים בידוק קפדני לאימות זיהוים, וזאת כדי למנוע אפשרות להחלפת אסירים או שחרור אסירים בעלי זהות דומה או שמות זהים באמצעות ארגוני הטרור. מבצע השבת החטופים, הזוכה לכינוי "כנפי דרור", מותנה בשחרור המחבלים תחת אחריותו המלאה של נציב שב"ס, רב-גונדר קובי יעקובי, שקיים הערכת מצב במסגרת מבצע "דרך ארץ".
בשב"ס מציינים כי בסיום ביצוע הפעולות הנדרשות בבתי הסוהר, לוחמי יחידת "נחשון", יחידת הליווי המרכזית של שב"ס, יעבירו את המחבלות והמחבלים לנקודת הקליטה המרכזית בבית הסוהר "עופר". עם הגעתם, יזוהו על-ידי נציגי ארגון הצלב האדום וימתינו עד להגעת החטופים הישראלים. רק לאחר השבת החטופים בכל פעימה ישוחררו במקביל האסירים הביטחוניים. עם קבלת אישור הגורמים המדיניים, המחבלים יוסעו מבית הסוהר "עופר" בידי הצלב האדום לנקודות השחרור.
חשוב לציין כי המחבל ראאד חאליל, מי שביצע את פיגוע הדקירה לפני כעשור במגדלי הפנורמה בתל אביב בו נרצחו שני ישראלים, אהרון יסייב וראובן אבירם, הוסר מרשימת האסירים שישוחררו. זאת בעקבות עתירה של פורום "בוחרים בחיים" לבג"ץ, במהלכה הוכיחו כי החוק קובע שלא ניתן לשחרר אסירים שהורשעו ברצח ולגביו קבע בית המשפט כי מדובר בביצוע המעשה בנסיבות חריגות בחומרתן. בשל כך, חאליל ימשיך לרצות את העונש שהושת עליו - שני מאסרי עולם ועוד 20 שנים.