החל משבעה באוקטובר ועד לתום כהונתו של הרצי הלוי בתפקיד הרמטכ"ל, צה"ל התנגד נחרצות להעברת ביקורת מצד מבקר המדינה על הצבא. למרות שסמכות המבקר מעוגנת בחוק יסוד, היועמ"שית לא הורתה לצבא לשתף פעולה עם המבקר. רק כעת, לאחר שהתחלף רמטכ"ל, הצבא הסכים לביקורת.
מבקר המדינה מתניהו אנגלמן אמר בוועידה הלאומית לאנרגיה 2025 של המכון הישראלי לאנרגיה וסביבה: "אני רוצה לברך את הרמטכ"ל רא"ל אייל זמיר עם כניסתו לתפקיד. שוחחתי איתו אמש והבוקר, וסיכמנו כי ביקורת המדינה תפתח בבדיקת סוגיות הליבה שגרמו לכשל ב-7.10. גם עם ראש השב"כ סוכם על שיתוף פעולה מלא".
לפני מספר ימים שירות הביטחון הכללי התקפל, והחליט לאפשר למבקר המדינה לבדוק את כשלי הארגון בשבעה באוקטובר. המבקר והשב"כ הודיעו את הדברים לשופטי בג"ץ במסגרת עתירה של תנועת אומ"ץ והתנועה לאיכות השלטון אשר הוגשה במקור בכדי לבלום את הביקורת של מבקר המדינה על השבעה באוקטובר ביחס לצבא, לשב"כ ולמוסד.
לפני כשבוע, מבקר המדינה מתניהו אנגלמן תקף את התנהלות הממשלה ביחס להחלטת צה"ל ושב"כ שלא לשתף פעולה באופן מלא עם ביקורת משרדו, ביקורת המתקיימת מכוח חוק יסוד מבקר המדינה. אנגלמן הוסיף כי תחקירי הצבא מוכיחים עד כמה ישנו צורך בביקורת חיצונית על ידי מבקר המדינה.
אנגלמן אמר את הדברים בישיבת הוועדה לביקורת המדינה בנושא דוח "חרבות ברזל" הראשון שפרסם לפני כשלושה שבועות, על הטיפול בבריאות הנפש לאחר שבעה באוקטובר: "כבר ב-10.10.2023 אמרתי שבבוא העת אפתח בביקורת נוקבת שתכלול אחריות אישית כלפי האחראים למחדל ולכשלים. קבעתי כי הביקורת תכלול את כלל הדרגים - המדיני, הצבאי והאזרחי. והוספתי כבר אז שככל שתקום ועדת חקירה ממלכתית אתאם עימה גבולות גזרה. המחוקק הסמיך אתכם להקים ועדת חקירה ממלכתית על בסיס דוח ביקורת המדינה".
"בחודש החולף פרסמנו חמישה דוחות חשובים מאוד, מתוך רבים שבהכנה. הם חשובים, אבל הציבור זכאי לתשובות על השאלות הקשות למחדל החמור בתולדות המדינה", אמר המבקר והוסיף: "אתמול הוצגו בפניי לראשונה ארבעה תחקירים פנימיים של צה"ל. מחר גם אקיים סיור בפיקוד הדרום ובשבוע הבא יוצגו בפניי תחקירים של השב"כ".
"לא אכנס לתוכן התחקירים, רק אציין שעלתה במלוא עוזה העובדה שכל גוף מקיים תחקירים בפני עצמו. צה"ל מקיים תחקירים במנותק משל השב"כ, וכך גם להיפך". המבקר הבהיר כי לעמדתו, התחקירים אינם מציגים את התמונה המלאה על כשלי השבעה באוקטובר.
אנגלמן אמר: "הדבר מחזק עוד יותר את החובה לקיים ביקורת על ליבת הכשל. משרד מבקר המדינה הוא הגוף היחיד שיכול לבצע סנכרון בביקורת בין כלל הדרגים - מראש הממשלה, שר הביטחון, ועד לרמטכ"ל, ראש השב"כ, ראש המוסד, משטרת ישראל, הרשויות המקומיות, ויתר הגופים. הקצתי לצורך ביקורות המלחמה כ- 200 עובדים שעמלים על דוחות אלו".
המבקר הציג את תמונת המצב בביקורת על כשלי שבעה באוקטובר: "לדרג המדיני כבר נכנסנו לפני חודשים. כך גם למוסד. כעת נותר להיכנס לביקורת בצה"ל ובשב"כ, לבצע את הסנכרון הנדרש ולעבוד על ביקורת על כלל המחדלים". המבקר מתח ביקורת על התנהלות צה"ל השב"כ והיועמ"שית: "אני מצפה מהרמטכ"ל, מראש השב"כ, ומהיועצת המשפטית לממשלה לעמוד על חוק יסוד מבקר המדינה ולהיכנס תחת כנפי הביקורת".